Evaluation génétique d’un programme de conservation ex situ de l’outarde houbara (Chlamydotis undulata undulata) au Maroc : apports à la gestion génétique des populations captives

Overview & Synopsis

Au-delà de produire des individus pour les translocations de conservation, les programmes de conservation ex situ se doivent de minimiser les risques de changements génétiques associés à la consanguinité, la dérive génétique et l’adaptation à la captivité, dans le but de préserver la diversité et le patrimoine génétiques des populations. Ceci est permis grâce à la mise en place d’une gestion génétique adaptée. Dans ce cadre, nous avons évalué les effets de la captivité sur le patrimoine génétique d’une population d’outarde houbara(Chlamydotis undulata undulata) maintenue en captivité au sein d’un programme de conservation ex situdepuis 1996. Nos résultats montrent que la gestion génétique a permis de préserver la diversité génétiquetout en maintenant un faible niveau de consanguinité. Néanmoins, nos résultats suggèrent que les analyses moléculaires et de pedigrees ne peuvent se substituer et représentent des sources d’informations complémentaires. De plus, une analyse combinant simulations informatiques, analyses de pedigrees et analyses moléculaires, a permis de souligner que l’hypothèse des fondateurs, selon laquelle les fondateurs des populations captives ne sont ni consanguins ni apparentés, pouvait mener à une surestimation de la diversité génétique et à une sous-estimation de la consanguinité des populations captives. L’analyse de paramètres de reproduction a permis de mettre en lumière des effets interactifs de l’âge, de la consanguinité et du nombre de générations en captivité sur les performances reproductrices. De plus, une analyse de génétique quantitative a montré que ces changements phénotypiques en captivité pouvaient être associés à des changements génétiques pour certains des paramètres étudiés. Enfin, nous avons mené une première approche dans le développement d’un modèle de gestion en métapopulation des populations captive et sauvage d’outarde houbara dans le but d’optimiser la préservation de la diversité génétique, tout en minimisant les risques d’adaptation à la captivité. Notre étude globale des effets de la captivité sur le patrimoine génétique des populations renforce l’intérêt de mesures telles que la minimisation de l’apparentement moyen, la collecte régulière de fondateurs ou la minimisation du nombre de générations en captivité, tout en suggérant la nécessité de mesures additionnelles telles que l’intégration de données moléculaires, la prise en compte de l’apparentement des fondateurs et la gestion en métapopulation des populations sauvage et captive.