Utilisation des protéines Pentatricopeptide Repeat Proteins (PPR) pour le contrôle de l’expression des gènes dans les organelles de plantes

Overview & Synopsis

Les protéines pentatricopeptide repeat (PPR) sont des protéines de liaison à l’ARN simple brin cruciales pour la régulation post-transcriptionnelles des gènes des organites semi-autonomes. Les protéines PPR sont associées à une grande variété de fonctions in vivo allant de la stabilisation des extrémités des transcrits à l’épissage des introns ou l’édition des ARN. Elles ont une structure modulaire faites d’une répétition d’un motif de 35 acides aminés qui se replie en deux hélices alpha. Chaque motif reconnait une base ARN grâce à un code en acides aminés nommé code PPR. Récemment, un motif PPR consensus et synthétique dit dPPR, qui répond au code PPR de manière prédictible a été développé et leur concaténation permet de créer des protéines PPR synthétiques capables de lier une séquence d’ARN désirée in vitro. Dans cette thèse de biologie synthétique, j’ai conçu des dPPR synthétiques inspirées des fonctions associées aux protéines PPR naturelle afin de manipuler in vivo l’expression des gènes des organites de plantes et de la bactérie.