Validation d'une méthode de déreplication de substances naturelles marines

Overview & Synopsis

L’émergence de résistance aux antibiotiques et aux anticancéreux est aujourd’hui définie par l’Organisation Mondiale de la Santé comme une crise de santé mondiale, incitant les chercheurs à développer des agents thérapeutiques innovants et plus spécifiques. L’industrie a restreint son recours aux substances naturelles végétales, notamment en raison de la fréquente redécouverte de composés connus. Les scientifiques tournent alors désormais leurs efforts vers le milieu marin, encore très peu exploité. Nous avons contribué à cet effort en participant au projet de recherche Européen PharmaSea axé sur la découverte, la caractérisation, et le développement de nouvelles substances pharmaceutiques tirées d'organismes marins. Une étape clé pour réussir dans la découverte de « médicaments de la mer » est la déréplication : l'identification rapide de composés déjà connus avant l’isolement. L’abondance de données et le manque d’informations confirmatives compliquent cette tâche. Différentes stratégies de déréplication comme la Chromatographie Liquide couplée à la Spectrométrie de Masse Haute Résolution émergent actuellement. Nous avons investigué la méthode de déréplication des données de masse de PharmaSea sur 21 extraits de tuniciers. Cette méthode est basée sur une combinaison du logiciel ACDLabs IntelliXtract et de la base de données MarinLit de la Royal Society of Chemistry. Grâce à l’ajout d’une analyse par Résonnance Magnétique Nucléaire, nous avons pu classer les extraits à étudier pour valider la méthode. Les plus prometteurs de nouveauté ont été purifiés, conduisant à l'isolement de sept composés dont cinq nouveaux, preuve de l'efficacité du mode de déréplication utilisé.