Horloges épigénétiques pour la longévité fonctionnelle des vaches laitières

Overview & Synopsis

Chez les bovins lait, la longévité fonctionnelle est un caractère d’intérêt majeur sur les plans économique, environnemental et du bien-être animal mais elle n’est mesurable que tardivement dans la vie des individus. L’objectif de ce stage était d’évaluer si l’âge épigénétique, prédit à partir de la méthylation de l’ADN pouvait constituer un biomarqueur précoce du vieillissement et de la longévité fonctionnelle. Le méthylome sanguin de 4 751 vaches Holstein a été analysé à l’aide de la puce RUMIGEN EpiChip, ciblant 44 053 sites CpGs. Plusieurs modèles de prédiction ont été comparés afin de construire une horloge épigénétique. Le meilleur modèle a prédit l’âge épigénétique des animaux avec une précision de 129 jours. L’écart entre l’âge épigénétique et l’âge réel a été calculé pour chaque animal. Dans les modèles analysés, cet écart présentait une héritabilité modérée et était associé à plusieurs régions génomiques où plusieurs gènes candidats ont été identifiés (dont DNMT3B et RCAN2). De plus, cet écart a permis d’observer que l’accélération du vieillissement épigénétique était associée à une réforme précoce des animaux. Ces résultats montrent qu’une horloge épigénétique peut être construite chez la vache laitière et que l’âge épigénétique pourrait constituer un éventuel biomarqueur précoce de la longévité fonctionnelle. Ces approches sont très prometteuses pour être appliquées à d’autres contextes et à différentes échelles d’étude.